قصة أنمي Mobile Suit Gundam: Iron-Blooded Orphans تدور بعد مرور 300 عامٍ من اندلاع حربٍ ما بين الأرضِ وكوكب المريخ تُعرف بـ "حرب النكبة" ونتيجة هذه الحرب هو احتلال البشر لكوكب المريخ. بغض النظر عن التقدم التقني الذي شهده كوكب المريخ منذ الإحتالال إلا أن سكان البشرين على كوكب المريخ يريدون الاستقلال عن حكومة الأرض. بطل العمل هو ميكازوكي آنغُس وهو عضو في مجموعة من الصغار ضمن منظمة أمن مدنية تُدعى سي جي إس ومهمتها هي مرافقة كوديليا آينا بيرنستاين التي تود المفاوضة على استقالال مدينة تشيرسي عن سيطرة الأرض. في يوم، تتم مهاجمة السي جي إس من قبل مجموعة غيالالالوهورن التي ترفض الاستقالال. يجد ميكازوكي نفسه في صراعٍ بين أن ينصاع لصديقه في التمرد ضد الاستقالال او أن يكمل مهمته، ولكن في أثناء ذلك، يجد في نصب عينيه مركبة بارباتوس الأسطورية.