قصة أنمي Flag تدور عام 20xx، عندما اندلعت حرب أهلية في بلد صغير في آسيا. على الرغم من إرسال الأمم المتحدة قواتها، إلا أن هناك صورة تم التقاطها عن طريق الصدفة في ساحة المعركة تُسرع من عملية السلام، إنها صورة لِعَلَم أصبح رمزًا للسلام. ومع ذلك، قبل وضع اللمسات الأخيرة على اتفاق السلام، يُسْرَق العَلَم من قِبَل مجموعة متطرفة مسلحة من أجل عرقلة الهدنة. من أجل إنقاذ العَلَم، تُرسل الأمم المتحدة قيادة التطوير الخاصة (SDC)، المسلحة بحاملة الأسلحة متعددة الاستخدامات (HAVWC)، إلى جانب مصورة صحفية مضمنة لتسجيل أنشطتها. هذه المصورة الصحفية هي سايكو شيراسو ، المصورة الشابة التي التقطت صورة العَلَم.