قصة أنمي Charlotte تبدأ عندما يمر مذنب يدعى شارلوت قرب الأرض كل 75 سنة، نشر المذنب غبارًا على الأرض، نسبة مئوية صغيرة من الأطفال قبل المراهقة استنشقوه و أصبحت لديهم قدرات خارقة قبل البلوغ. تتابع القصة البطل يو أوتوساكا، وهو فتى لديه القدرة على تملُّك الآخرين. على الرغم من إرادته لاستعمال قدرته ليعيش حياة الثانوية سعيدًا عن طريق الاحتيال، كُشِفَ أمره من طرف ناو توموري، وهي فتاة يمكنها جعل نفسها خفية لهدف معين، وأجبرته لينتقل إلى أكاديمية هوشينومي (أكاديمية بحر النجوم) و الانضمام إلى مجلس الطلبة، الذي تترأسه هي، لتستمر الأحداث.